Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2888K7N746 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms