Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc191J3QQ27 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms