Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm2056J3QQ02 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm2056J3QQ02 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm2056J3QQ02 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm2056J3QQ02 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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