Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm21900J3QP38 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms