Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms