Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc180J3QNE4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
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