Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms