Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm11236J3QMS7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm11236J3QMS7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm11236J3QMS7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm11236J3QMS7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm11236J3QMS7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm11236J3QMS7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm11236J3QMS7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm11236J3QMS7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm11236J3QMS7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm11236J3QMS7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Gm11236J3QMS7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Gm11236J3QMS7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm11236J3QMS7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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