Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cldn34c3J3QJW5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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