Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms