Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm20830J3KML6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm20830J3KML6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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