Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gm28038F7BCN9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gm28038F7BCN9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gm28038F7BCN9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gm28038F7BCN9 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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