Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm28048F7BCN0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm28048F7BCN0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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