Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atf6F6VAN0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms