Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pagr1bF6V0H0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pagr1bF6V0H0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms