Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm20518E9Q548 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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