Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms