Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Srp54bE9PXC0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms