Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms