Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms