Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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