Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf217D3YYI7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms