Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc170D3YXL0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms