Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cttnbp2B9EJA2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms