Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms