Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Abcc8B2RUS7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms