Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zscan5bB2RTN3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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