Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms