Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf1bp1B2KF50 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms