Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms