Protein–RNA interactions for Protein: B1AQP7

Apol7b, Apolipoprotein L 7b, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7bB1AQP7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apol7bB1AQP7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Apol7bB1AQP7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Apol7bB1AQP7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7bB1AQP7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms