Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem238A9JSM3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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