Protein–RNA interactions for Protein: A7KBS4

Zscan4d, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4dA7KBS4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Zscan4dA7KBS4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Zscan4dA7KBS4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Zscan4dA7KBS4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zscan4dA7KBS4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms