Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms