Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf39A2RT81 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf39A2RT81 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf39A2RT81 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf39A2RT81 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf39A2RT81 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf39A2RT81 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf39A2RT81 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf39A2RT81 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf39A2RT81 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms