Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scn3aA2ASI5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms