Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Rtf1A2AQ19 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Rtf1A2AQ19 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Rtf1A2AQ19 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Rtf1A2AQ19 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Rtf1A2AQ19 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtf1A2AQ19 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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