Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtcflA2APF3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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