Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c4A2ANA3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c4A2ANA3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms