Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GabreA2AMW3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms