Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn6A2AJB9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn6A2AJB9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms