Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms