Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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