Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3550W4VSN7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms