Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Csmd2V9GX34 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms