Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top3bQ9Z321 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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