Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slfn1Q9Z0I7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Slfn1Q9Z0I7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms