Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms