Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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VapaQ9WV55 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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VapaQ9WV55 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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VapaQ9WV55 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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VapaQ9WV55 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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VapaQ9WV55 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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VapaQ9WV55 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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VapaQ9WV55 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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VapaQ9WV55 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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VapaQ9WV55 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VapaQ9WV55 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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