Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf13bQ9WU72 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms